现代柯尔克孜人丧葬大部分按伊斯兰教规进行。在信仰伊斯兰教的家庭里，人死后把“埋体”（遗体）洗净，用白布把全身缠住，用素色布覆盖，头朝西放在房内的帐帘里。家中的妇女面朝西边哭边唱，历数死者的生平善举。亲友则带财物前来吊唁，诵经示哀。“埋体”在家一般停放一天，最多不超过三天。葬礼在清真寺举行，由阿訇念经致悼词后，即用“塔吾提”(抬尸的木架)或骆驼把尸体送往墓地土葬。埋葬时，死者头向北，脚向南，面朝西。死者死后的3日、7日、40日和1周年时，都要举行“乃孜尔”，以寄托对死者的缅怀和哀悼之情。居丧之家，一年内不能举行婚礼和其他文娱活动。
另外，对于婚礼和丧葬，塔城地区和黑龙江省富裕县的柯尔克孜人或按喇嘛教规进行，或按萨满教规进行。